לעתים מתעורר חשש שהאוויר הנע בתוך המבנה מכיל חומרים מזהמים, בין אם מקורם מתחת לפני הקרקע או בין אם הם מגיעים ממקורות חיצוניים אחרים. לצורך אישוש או שלילת חשש זה יש לבצע דיגום אוויר תוך-מבני, במהלכו מציבים בנקודות שונות במבנה מיכלים ייעודיים השואבים דגימות מהאוויר. הדגימות נבחנות במעבדה אנליטית ותוצאות המעבדה מעובדות על ידי היועץ הסביבתי לצורך מתן חוות דעת והמלצות.
